Chez les inséparables, les parasitoses restent exceptionnelles. Les vers intestinaux que nous pouvons rencontrer sont des vers en forme de spaghetti, nommés ascaris. Malgré un risque d'infection limité chez les agapornis, il est conseillé de les vermifuger au printemps et à l'automne par sécurité.

D'autres parasites internes peuvent être potentiellement rencontrés chez les agapornis. Notamment les coccidies, les trichomonas, mais ils touchent principalement les faisans, les pigeons, ou les volailles.